Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms