Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms