Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TapbpQ9R233 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms