Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtpaQ8BWP5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms