Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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