Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms