Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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