Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms