Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms