Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc52a2Q9D8F3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a2Q9D8F3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms