Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp19Q9D7A6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms