Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKP4Q99569 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PKP4Q99569 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms