Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT1Q8TDG2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT1Q8TDG2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT1Q8TDG2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT1Q8TDG2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT1Q8TDG2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms