Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d9Q3UYK3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbc1d9Q3UYK3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms