Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms