Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRHP20396 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRHP20396 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRHP20396 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRHP20396 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRHP20396 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRHP20396 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRHP20396 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRHP20396 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRHP20396 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRHP20396 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRHP20396 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms