Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18530 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18530 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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