Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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