Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms