Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms