Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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