Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim58Q5NCC9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim58Q5NCC9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim58Q5NCC9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim58Q5NCC9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim58Q5NCC9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim58Q5NCC9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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