Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam107bQ3TGF2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms