Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spata18Q0P557 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms