Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NapbP28663 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NapbP28663 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NapbP28663 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NapbP28663 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NapbP28663 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NapbP28663 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NapbP28663 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NapbP28663 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NapbP28663 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NapbP28663 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms