Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2afxP27661 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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