Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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