Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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