Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf250Q7TNU6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms