Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms