Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall3Q62255 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms