Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms