Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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