Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms