Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms