Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms