Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms