Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top3bQ9Z321 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms