Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDDC3Q8N4P3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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