Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2eQ80UW8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2eQ80UW8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms