Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms