Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Krtap9-3Q3V2C1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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