Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms