Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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