Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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