Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms