Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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