Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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