Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms