Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms